Logo PEKA melambangkann dua tangan yang saling membantu dan melengkapi iaitu tangan biru melambangkan barisan kepimpinan manakala tangan maroon melambangkan keseluruhan kakitangan akademik UPSI.
Perkataan besar PEKA-UPSI melingkungi di bahagian atas kedua-dua tangan memperlihatkan keberadaan PEKA yang jelas di dalam sistem universiti dan mendapatkan dokongan padu daripada kesemua kakitangan akademik UPSI.
Perkataan PERSATUAN KAKITANGAN AKADEMIK yang melingkungi bahagian bawah melambangkan kakitangan akademik UPSI sebagai ahli dan akar-umbi yang sentiasa prihatin dengan gerak-kerja dan akitiviti persatuan.
